W 1999 roku w Nashville został założony zespół metalu awangardowego Tomahawk, którego Stanier został członkiem. Ich debiutancki album o został wydany w 2001 roku. W kolejnych latach nagrał z zespołem albumy: w 2003 roku, w 2007 roku, w 2013 roku i w 2021 roku.
W 2001 roku zadebiutował w australijskim zespole . Brał udział przy nagraniu singla „Retaliate” z albumu This Is This.
W 2002 roku założył wraz z gitarzystą i keyboardzistą Ianem Williamsem, basistą i gitarzystą Davem Konopką oraz gitarzystą, klawiszowcem i wokalistą Tyondaiem Braxtonen zespół Battles. Debiutancki minialbum grupy, , wydany został przez wytwórnię w czerwcu 2004 roku, a w maju 2007 roku opublikowali debiutancką płytę studyjną Mirrored, która zdobyła szerokie uznanie krytyków. W 2010 roku zespół opuścił Braxton, a w 2018 roku Konopka i od tego czasu Stainer wraz z Willimasem zaczęli występować w Battles jako duet.
Współpracował także jako perkusista przy nagrywaniu albumów dla następujących zespołów i artystów: , Primer 55, Align, , Melissa Auf dr Maur, Prefuse 73, i .
Mieszka na Brooklynie.
Dyskografia Helmet (1990) Meantime (1992) (1994) (1997)