Drugi etap odbywał się na poziomie centralnym i obejmował 1/8 finału, ćwierćfinały, półfinały oraz finał. We wszystkich rundach obowiązywał system pucharowy. Pary wyłaniano w drodze losowania. Losowanie 1/8 finału przeprowadzono 17 września, ćwierćfinałów – 10 października, a półfinałów – 15 listopada 2024 roku.
W 1/8 finału do rozgrywek dołączyły zespoły z Superligi. Osiem najwyżej sklasyfikowanych drużyn Superligi sezonu 2023/2024 nie mogło na siebie trafić. O awansie decydował jeden mecz, którego gospodarzem był zespół z czołowej ósemki Superligi poprzedniego sezonu.
W ćwierćfinałach o awansie decydował dwumecz. Za zwycięstwo 3:0 lub 3:1 drużyna otrzymywała 3 punkty, za zwycięstwo 3:2 – 2 punkty, za porażkę 2:3 – 1 punkt, natomiast za porażkę 1:3 lub 0:3 – 0 punktów. Jeżeli w ramach dwumeczu oba zespoły zdobyły taką samą liczbę punktów, rozgrywały tzw. złoty set do 15 punktów z konieczną przewagą dwóch punktów jednego z zespołów. W ćwierćfinałach nie mogły ze sobą stworzyć pary trzy najwyżej sklasyfikowane drużyny Superligi oraz zdobywca Pucharu Serbii z poprzedniego sezonu, a jeśli zdobywca Pucharu Serbii był wśród tych trzech zespołów lub nie zakwalifikował się do tej fazy, wówczas cztery najlepsze drużyny Superligi.