Grupa 3 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Hajduk Split10.000 NK Maribor9.500 AEK Ateny9.500 FC KoszyceDAC Dunajská Streda została wykluczona z europejskich pucharów z powodu tego, że ma tego samego właściciela co inny klub biorący udział w rozgrywkach Győri ETO FC, co jest niezgodne z regulaminem. Po odrzuceniu przez CAS odwołania DAC Dunajská Streda jej miejsce w Lidze Konferencji zajęły FC Koszyce. Jako, że losowanie par II rundy kwalifikacyjnej odbyło się przed tą decyzją FC Koszyce przjęły współczynnik wykluczonego klubu.8.000 Partizan Belgrad7.500 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. FK Ołeksandrija4.880 Paksi FC4.800 Hapoel Beer Szewa4.500 Zirə Baku4.000 Nioman Grodno4.000
Grupa 4 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. HJK Helsinki12.500 Víkingur Reykjavík10.750 Piunik Erywań8.500 FC Vaduz7.500 Spartak Trnawa7.000 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Hibernians5.500 KF Vllaznia5.000 Győri ETO FC4.800 Arda Kyrdżali3.975 Dungannon Swifts F.C.1.666
Grupa 5 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Sparta Praga29.500 Charleroi11.370 Riga FC10.000 Silkeborg IF6.796 Nõmme Kalju6.500 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. St Patrick’s Athletic5.500 Hammarby IF5.500 Dila Gori4.000 Aktöbe FK3.000 KA Akureyri2.704