Po dotarciu na miejsce Jones słyszy o planie Emmericha Vossa dotyczącym kradzieży figurki Ra. Następnie zakrada się do biura antagonisty pod jego nieobecność, znajduje tam ciało martwego Olbrzyma, po czym Voss nieoczekiwanie wraca do biura, a bohatera czeka walka na pięści. Po potyczce Jones udaje się do starożytnych jaskiń, gdzie po przemierzeniu różnych korytarzy i odblokowaniu drzwi staje do kolejnej walki, tym razem ze ślepym Olbrzymem. Gdy Indy go pokona, wraca na powierzchnię. Przy wyjściu z kompleksu zostaje zasypany po szyję piaskiem; krótko po tym zjawia się Voss, odbierając bohaterowi fragment figurki. Zanim antagonista zniknie, słychać meldunek o odnalezieniu zaginionej ekspedycji z Peru w Himalajach. Przyjaciele ratują Indianę, który następnie wraz z Giną udaje się w Himalaje, aby rozwiązać kolejną zagadkę i odzyskać skradziony eksponat. Po dotarciu na miejsce bohater musi dostać się do unieruchomionej łodzi i poszukać wskazówek, które wyjaśnią, co się tam wydarzyło. Krótko potem rozpoczyna się ucieczka ze statku, który zaczyna się rozpadać. Bohaterowie skaczą w anomalię wytworzoną przez artefakt i przenoszą się do wojennego Szanghaju.