Pierwsza informacja dotycząca miejscowości pochodzi z 1563 roku. Czarnogłów był miejscowością gminną, parafia Wiśniew. W 1783 roku właścicielem wsi był Świniarski. W 1827 roku w Czarnogłowie było 20 domów i 176 mieszkańców, 50 lat później istniało 13 domów i 196 osadników. Folwark Czarnogłów z wsią Duchnów zajmował 781 mórg ziemi, posiadał młyn wodny z rybołówstwem i pokłady rudy. W gminie Czarnogłów mieszkało 1556 osób a powierzchnia obszaru wynosiła 5279 mórg. Należały do niej wsie: Czarnogłów, Czarnogłówska Wólka, Duchnów, Kamienna, Pokrzywnik, Turek, Wiśniew i Zimnowoda. W gminie były dwa młyny wodne i szkoła początkowa.
Prywatna wieś szlachecka położona była w drugiej połowie XVI wieku w ziemi liwskiej województwa mazowieckiegoCorona Regni Poloniae. Mapa w skali 1:250 000, Instytut Historii im. Tadeusza Manteuffla Polskiej Akademii Nauk i Pracownia Geoinformacji Historycznej Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego.
Do 1922 roku istniała gmina Czarnogłów.