Kontrowersje W roku 2009 Nonsensopedia została uznana przez gminy żydowskie oraz antyfaszystowskie Stowarzyszenie „Nigdy Więcej” za stronę internetową propagującą treści antysemickie. Zostało to spowodowane artykułami o Adolfie Hitlerze oraz Żydach. Gminy żydowskie oraz Stowarzyszenie „Nigdy Więcej” oceniły Nonsensopedię jako antysemicką ze względu na obecne w wyżej wymienionych artykułach sformułowania takie jak „Adolf Hitler to uosobienie dobra. Złoty człowiek kochał ludzi w komorach gazowych”, czy „nieprawdą jest, że Żydzi byli ofiarami. Niemcy ich unicestwiali, gdyż często sami ich prowokowali (…)”. Wniesioną skargę badała prokuratura, jednak nie zostało jednoznacznie uznane, że te artykuły z Nonsensopedii przekroczyły granicę żartu oraz same artykuły nie zostały usunięte. Nonsensopedia jest też przez niektórych uważana za promującą komunizm, z powodu dużej ilości artykułów na ten temat.
W roku 2011 Nonsensopedia po raz drugi została oskarżona o propagację antysemityzmu.