W okresie reformacji świątynia przeszła w ręce kalwinistów, usunięto wówczas wszystkie ołtarze, a malowidła pobielono. W 1675 prezbiterium wyremontowano po uszkodzeniach z czasów wojny trzydziestoletniej. Od 1690 roku budynek służył jako kościół symultaniczny – katolicy odprawiali nabożeństwa w prezbiterium, a protestanci – w korpusie nawowym, które w tym celu oddzielono od siebie pierw kratą, a następnie murem. W pierwszej dekadzie XVIII wieku katolicy przenieśli się tymczasowo do ratusza miejskiego, a następnie wznieśli własny przy Neuweg.
W 1821 wyremontowano dach, w latach 1849–1851 odrestaurowano okna, a w latach 1876–1877 kościół poddano renowacji. W 1904 wyremontowano posadzkę i zainstalowano ogrzewanie. W 1940 roku, w celu odróżnienia go od innych kościołów w mieście, nadano mu nazwę Burgkirche. Budynek odrestaurowano w latach 1952–1964 i 1994–2006. W 2012 roku wznowiono pochówki na otaczającym kościół cmentarzu.