Jako administrator w Sobiesękach w szybkim czasie odbudował życie zborowe i zaktywizował miejscową ludność protestancką do prac społecznych. Jego staraniem w latach 1882–1884 wybudowano we wsi nowy kościół oraz pastorówkę. W 1884 roku objął funkcję pastora parafii luterańskiej w Łomży. Zaangażował się energicznie w remont kościoła popijarskiego, a użytkowanego do nabożeństw przez zbór luterański. Jego staraniem w latach 1889-1890 wybudowano Dom Pastora w Łomży. Poza pracą w mieście gubernialnym Kacper Mikulski przejął ciężar służby dla wspólnot ewangelików we wschodniej i północnej części Królestwa Polskiego. Był duszpasterzem w: Paproci Dużej, Grajewie, Jedwabnem, Ostrołęce, Płatkownicy, Sadolesiu, Szczuczynie i Węgrowie. Na pograniczu prusko-rosyjskim organizował nabożeństwa luterańskie w języku polskim dla Mazurów z Prus Wschodnich.