W latach 1991–2006 był członkiem Centralnej Komisji do spraw Tytułu Naukowego i Stopni Naukowych przy Prezesie Rady Ministrów. W 2006 przeszedł na emeryturęZmarł prof. dr hab. inż. Włodzimierz Załachowski na stronie Morskiego Instytutu Rybackiego w Gdyni (dostęp 31.10.2025).

Włodzimierz Załachowski został pochowany 10 października 2025 na Cmentarzu Junikowo w Poznaniu.

Praca naukowo-dydaktyczna Włodzimierz Załachowski prowadził badania naukowe zależności pokarmowych pomiędzy populacjami najważniejszych pod względem gospodarczym gatunków ryb bałtyckich. W latach 1981–1989 uczestniczył w pracach grupy roboczej powołanej przez Międzynarodową Radę Badań Morza do szacowania zasobów Bałtyku na podstawie modeli wielogatunkowych. Profesor Załachowski prowadził przedmioty biologia ryb i ekologia populacji rybnych. Wypromował 5 doktorów i 67 magistrów inżynierów. Był opiekunem roku w 2 kadencjach (1973–1975 i 1986–1990). W 1989 był także promotorem doktora honoris causa profesora Eugeniusza Grabdy.