Warto zaznaczyć, że sama nie brała bezpośredniego udziału w powstaniu, przebywając wówczas we Francji; o wydarzeniach dowiedziała się z prasy.
W okresie wojny o niepodległość (1919–1921) aktywnie działała w Irish White Cross (Biały Krzyż), organizacji humanitarnej niosącej pomoc ofiarom konfliktu. Współpracując z Arthurem Griffithem, organizowała warsztaty pracy dla uchodźców z Belfastu oraz interweniowała w szpitalach zakonnych, by ranni ochotnicy republikańscy nie byli obciążani kosztami leczenia.
Podczas wojny domowej, mimo początkowej niechęci do opowiadania się po którejś ze stron, jej dom przy St Stephen's Green w Dublinie stał się celem ataku wojsk Wolnego Państwa. W trakcie nalotu żołnierze spalili przed domem jej prywatne archiwum, w tym bezcenną korespondencję z W.B. Yeatsem, Pádraigiem Pearse'em i Jamesem Connollym, co oznaczało dotkliwą stratę cennych materiałów źródłowych. W październiku 1922 roku Gonne wraz z Charlotte Despard, znaną brytyjską działaczką, współzałożyła Women's Prisoners' Defence League (Liga Obrony Więźniarek), której członkinie, organizujące protesty i czuwania pod więzieniami, zyskały przydomek „The Mothers”.
Okres międzywojenny, II wojna światowa i ostatnie lata