Niezależnie od przyjętej nazwy, w obu przypadkach chodzi o niekowalencyjny układ typu gospodarz–gość, w którym składnik gościa znajduje się we wnęce gospodarza lub w przestrzeniach jego sieci krystalicznej.
Charakter wiązania i powstawanie Chemia supramolekularna opisuje układy (supercząsteczki) tworzone przez cząsteczki lub jony powiązane słabymi oddziaływaniami niewiążącymi, których suma może istotnie zmieniać właściwości układu względem składników wyjściowych. W związkach inkluzyjnych nie powstają wiązania kowalencyjne między gościem a gospodarzem, a oddziaływanie bywa opisywane jako wypadkowa sił niekowalencyjnych, w tym (zwykle) sił van der Waalsa.
W przypadku kompleksów cyklodekstryn wskazuje się udział m.in. oddziaływań van der Waalsa, sił dyspersyjnych oraz wiązań wodorowych, a w roztworach wodnych znaczenie ma także zastępowanie cząsteczek wody w hydrofobowej wnęce cyklodekstryny przez mniej polarnego gościa.
Typy Związki kanałowe (tunelowe) W części związków inkluzyjnych gospodarz tworzy równoległe, jednowymiarowe tunele/kanały, w których lokują się cząsteczki gościa;