Charakterystyka Rezerwat Biosfery Río Plátano jest największym obszarem chronionym w Hondurasie. Obejmuje zachowane w bardzo dobrym stanie pozostałości lasów tropikalnych porastających niegdyś całą Amerykę Środkową. Rezerwat obejmuje swoim obszarem całą zlewnię rzeki , która płynie przez ok. 45 km od źródeł w górach Kordyliery Środkowej aż do ujścia do Morza Karaibskiego, tworząc liczne starorzecza. Wraz z innymi pobliskimi obszarami chronionymi (m.in. , oraz w sąsiedniej Nikaragui) tworzy największy poza Amazonią zwarty obszar leśny w Ameryce Łacińskiej.
Rezerwat charakteryzuje się bardzo wysoką różnorodnością występujących tu ekosystemów oraz gatunków roślin i zwierząt. Średnia roczna temperatura powietrza wynosi 20–26 °C, a roczne opady deszczu oscylują między 2000 a 4000 mm. Teren rezerwatu jest przeważnie górzysty i opada w kierunku morza. Pas wybrzeża obejmuje piaszczyste plaże oraz system estuariów i lagun o zróżnicowanym zasoleniu. Porastają go gęste lasy namorzynowe. Dalej w głąb lądu występują obszary podmokłe, na których rośnie m.in. paurota florydzka (Acoelorraphe wrightii), oraz sawanny z tropikalnymi gatunkami sosen (np. Pinus teocote), poprzecinane dolinami rzek i strumieni, wzdłuż których rosną lasy galeriowe pełniące rolę korytarzy ekologicznych.