Działalność komercyjna i dydaktyczna Istotną częścią życia zawodowego Mark była działalność dydaktyczna. Przez blisko 30 lat prowadziła warsztaty fotograficzne, z których najsłynniejsze odbywały się corocznie w Oaxaca w Meksyku. Regularnie nauczała również w The Center for Photography at Woodstock (CPW), gdzie dzieliła się swoją wiedzą z zakresu dokumentu i portretu. Pełniła także funkcję wykładowcy wizytującego (Guest Juror/Teacher) na wielu innych prestiżowych uczelniach i w instytucjach kulturalnych.
Oprócz projektów dokumentalnych i artystycznych, Mark zajmowała się również fotografią komercyjną. Realizowała kampanie reklamowe dla znanych światowych marek, takich jak Barnes & Noble, Levi’s, Nissan czy Heineken.
Technika i inspiracje Mary Ellen Mark używała szerokiej gamy aparatów analogowych, dobierając sprzęt do specyfiki projektu. Korzystała m.in. z małoobrazkowych aparatów Leica M6 i Canon EOS-1N do dynamicznego reportażu, średnioformatowych aparatów Hasselblad (który ceniła za kwadratowy format) i Mamiya 7 oraz aparatów wielkoformatowych 4×5 cala (np. Linhof). Pozostała wierna fotografii analogowej, krytykując nadmierne użycie cyfrowej manipulacji w prasie. Preferowała tradycyjne odbitki srebrowe.