Tymczasowy Rząd Wolnych Indii 29 grudnia 1943 roku kontrolę polityczną nad wyspami formalnie przejął rząd Azad Hind pod przewodnictwem Subhasa Czandry Bose. Bose odwiedził Port Blair, aby wywiesić trójkolorową flagę Indyjskiej Armii Narodowej. Podczas tej jedynej wizyty na Andamanach był starannie ukrywany przed miejscową ludnością przez japońskie władze. Podejmowano liczne próby poinformowania go o cierpieniach mieszkańców Andamanów oraz o tym, że wielu lokalnych indyjskich nacjonalistów było wówczas torturowanych w więzieniu Cellular. Bose najwyraźniej nie zdawał sobie z tego sprawy, a niektórzy uważają, że „zawiódł swój lud”. Po odejściu Bosego Japończycy nadal sprawowali faktyczną kontrolę nad Andamanami, a suwerenność Tymczasowego Rządu Wolnych Indii nad wyspami była w dużej mierze fikcyjna. Same wyspy przemianowano na „Shaheed” i „Swaraj”, co oznacza odpowiednio „męczennik” i „samorządność”. Bose mianował płk. A.D. Loganathana gubernatorem wysp i miał ograniczony udział w administrowaniu terytorium. Podczas przesłuchania po wojnie Loganathan przyznał, że miał pełną kontrolę jedynie nad szczątkowym departamentem edukacji na wyspach, ponieważ Japończycy zachowali kontrolę nad policją, a w proteście odmówił przyjęcia odpowiedzialności za jakiekolwiek inne obszary administracji.