Dysbioza () – termin używany w naukach biomedycznych na określenie zmian w składzie i/lub funkcjach mikrobioty (zbioru mikroorganizmów zasiedlających dane środowisko), które są powiązane ze stanem chorobowym albo z zaburzeniem równowagi fizjologicznej gospodarza. Pojęcie to bywa stosowane w odniesieniu do różnych „miejsc” organizmu (m.in. jelit, jamy ustnej, dróg oddechowych, skóry czy pochwy), a nie tylko do mikrobioty jelitowej.
W literaturze podkreśla się, że „dysbioza” jest pojęciem opisowym (heurystycznym), a nie jednoznaczną jednostką chorobową ani rozpoznaniem klinicznym, ponieważ nie istnieje jedna, powszechnie przyjęta definicja prawidłowej mikrobioty dla wszystkich ludzi i warunków.
Definicja i zakres W ujęciu przeglądowym dysbiozę opisuje się jako stan, w którym obserwowane są zmiany w mikrobiocie (np. w obfitości poszczególnych taksonów, w różnorodności albo w wytwarzanych metabolitach) i jednocześnie zmiany te są związane z funkcjonowaniem organizmu gospodarza, w tym z odpornością i metabolizmem. Zależnie od kontekstu badawczego dysbioza może oznaczać przede wszystkim: zmianę składu (dysbiozę kompozycyjną) lub zmianę funkcji (dysbiozę funkcjonalną), gdy istotniejsze są różnice w szlakach metabolicznych i produktach mikrobioty niż sama lista gatunków.