Następnie pełnił służbę w Biurze Hydrograficznym Marynarki Wojennej na różnych stanowiskach, w tym zastępcy szefa Biura. 23 maja 1990 r. objął stanowisko szefa Biura Hydrograficznego MWCzasopismo Marynarki Wojennej „Przegląd Hydrograficzny” Nr 2 z 2006 r. Gdynia str. 24.
W 1990 r. uczestniczył jako przewodniczący polskiej delegacji w IV Konferencji Komisji Hydrograficznej Morza Bałtyckiego BSHC (Baltic Sea International Chart Comitteee - BSICC) w Rostocku, w 1993 r. w V Konferencji BSHC w Danii na wyspie BornholmCzasopismo Marynarki Wojennej „Przegląd Hydrograficzny” Nr 1 z 2005 r. Gdynia str. 55. W 1992 r. złożył oficjalną wizytę w szwedzkim Departamencie Hydrografii na okręcie ORP Kopernik. W 1995 r. był organizatorem VI konferencji BSHC, która obradowała w Gdyni, a miejscem obrad był Ośrodek Żeglarski Marynarki Wojennej „Kotwica”. W obradach uczestniczyło 24 przedstawicieli służb hydrograficznych wszystkich państw członkowskich BSHC oraz obserwatorzy z Litwy i Estonii. Kmdr Władysław Kierzkowski na zakończenie obrad został wybrany na przewodniczącego BSHC, na dwuletnią kadencję.