Ich działalność koncentrowała się na zapewnieniu prawidłowego przebiegu procesów gospodarczych, finansowych i organizacyjnych w podległych jednostkach, a także na podnoszeniu poziomu fachowego kadr oraz efektywności zarządzania.
W szczególności Inspektoraty przeprowadzały kontrole i rewizje działalności przedsiębiorstw PGR, obejmujące zarówno ocenę prawidłowości gospodarowania, jak i zgodności działań z obowiązującymi przepisami oraz wytycznymi planowymi. Istotnym elementem ich pracy było sprawowanie instruktażu fachowego, polegającego na udzielaniu wskazówek organizacyjnych i technologicznych, a także inicjowanie i wspieranie doskonalenia zawodowego kadr kierowniczych oraz specjalistycznych. Inspektoraty udzielały również pomocy merytorycznej przedsiębiorstwom w zakresie realizacji powierzonych im zadań produkcyjnych i administracyjnych.
Znaczącą część kompetencji Inspektoratów stanowił udział w procesie planowania gospodarczego. Współuczestniczyły one w opracowywaniu planów gospodarczych przedsiębiorstw PGR, brały udział w ich przyjmowaniu oraz dokonywały analizy podstawowych założeń planowych.