Poglądy na media i dziennikarstwo Zbigniew Bajka jest zwolennikiem dziennikarstwa obywatelskiego, widząc w nim szansę na ulepszanie rzeczywistości i zwiększanie wpływu obywateli na władzę. Za kluczowy moment rozwoju tego ruchu w Polsce uważa Okrągły Stół i wybory w 1989 roku, a następnie upowszechnienie Internetu, który umożliwił interaktywność i masowe działanie (np. poprzez serwisy społecznościowe).
Krytycznie ocenia kondycję współczesnego środowiska dziennikarskiego, wskazując na brak silnej reprezentacji zawodowej (związków zawodowych), niepewność zatrudnienia oraz zależność dziennikarzy od właścicieli mediów („czwarta władza to dzisiaj władza właścicieli mediów”). Zauważa również problem upolitycznienia mediów i wchodzenia dziennikarzy w układy z politykami.
Życie prywatne i zainteresowania Jego żoną jest Jadwiga (socjolog medycyny, wykładowczyni Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego). Ma córkę Aleksandrę (dziennikarkę, korespondentkę RMF FM i TVN, mieszkającą w USA).
Jest miłośnikiem przyrody i aktywnego wypoczynku. Posiada dom w Beskidzie Żywieckim, gdzie zajmuje się majsterkowaniem. Jego pasjami są myślistwo (należy do Polskiego Związku Łowieckiego), zbieranie grzybów oraz wędrówki górskie.