Jednak na tym idealnym tle zaczęły pojawiać się pierwsze rysy, które przerodziły się w poważne uszkodzenia. Po rundzie jesiennej sezonu 2012/2013 okazało się, że klub jest zadłużony, przed sezonem odeszło kilku podstawowych piłkarzy a do rundy wiosennej zespół miał nie przystąpić. Został odwołany stary zarząd, powołano nowy i zatrudniono nowego trenera. Przez kolejne lata Klub grał przeważnie w lidze okręgowej z pojedynczymi debiutami na wyższym szczeblu. Od sezonu 2024/25 gra w V lidze.
Nazwy klubu 1926 r. – Klub Sportowy „Unia” Sierpc; 1967 r. – Klub Sportowy „Tęcza” Sierpc (połączenie KS Unia z *KS Tęcza); 1968 r. – Spółdzielczy Klub Sportowy „Start” Sierpc (połączenie KS Tęcza z SKS „Start”); 14.03.1991 r. – Międzyzakładowy Klub Sportowy „Kasztelan”; 01.07.1996 r. - Miejski Klub Sportowy „Kasztelan” (połączenie MZKS „Kasztelan” z KS „Marjoss” i TKKF przy Zakładach Piwowarskich w Sierpcu). 10.04.2000 MKS Kasztelan Sierpc.