Miasto było ponownie oblegane przez Szwedów w 1642 r.Tamże, s. 76.. Szwedzkie wojska pod wodzą feldmarszałka Torstenssona oblegały twierdzę od 25 czerwca do 25 lipcaTamże, s. 149.. To pierwsze regularne oblężenie zostało odparte przez załogę twierdzy. Za główny powód odstąpienia Szwedów uznaje się zbliżającą się odsiecz arcyksięcia Leopolda WilhelmaTamże, s. 155-156.. Mimo że twierdza brzeska nie została zdobyta, oblężenie ujawniło słabe punkty jej fortyfikacji. Podjęte w tym samym roku prace remontowe i rozbudowa były utrudnione przez osuwającą się glebę i wysokie koszty utrzymania umocnieńTamże, s. 161-164..
Po śmierci Jerzego Wilhelma w 1675 r., ostatniego z dynastii Piastów księcia Brzegu, miasto przeszło pod bezpośrednie władztwo króla czeskiego i cesarza Leopolda I HabsburgaTamże, s. 180..