Dodano również postacie niezależne odgrywające istotną rolę w świecie gry.
Rozgrywka Warframe łączy elementy strzelanek trzecioosobowych i parkoura z dynamiczną walką wręcz oraz rozbudowanym systemem rozwoju postaci. Gracz wciela się w Tenno, którzy posługują się biomechanicznymi pancerzami bojowymi zwanymi Warframe’ami. Każdy pancerz posiada unikalne zdolności specjalne oraz odmienny styl gry.
Rozgrywka opiera się głównie na misjach instancyjnych, które można wykonywać w pojedynkę lub w trybie kooperacyjnym dla maksymalnie ośmiu graczy. Misje obejmują m.in. eliminację przeciwników, obronę celów, sabotaż, infiltrację oraz misje fabularne. Gra kładzie nacisk na szybkość poruszania się, wykorzystując system parkouru umożliwiający bieganie po ścianach, ślizgi czy akrobatyczne skoki.
Gracze zdobywają doświadczenie, rozwijając swoje Warframe’y, broń oraz towarzyszy. Istotnym elementem rozwoju jest system modyfikacji, który pozwala na zmiany statystyk i zdolności.