18 listopada 2016 w Warszawie minister obrony narodowej Antoni Macierewicz wręczył mu nominacje na stanowisko służbowe zastępcy dyrektora Departamentu Budżetowego, które pełnił do końca 2020. 4 stycznia 2021 minister obrony narodowej Mariusz Błaszczak wyznaczył płk. Dariusza Mendralę na stanowisko dyrektora Zakładu Inwestycji Organizacji Traktatu Północnoatlantyckiego.
1 marca 2021 prezydent RP Andrzej Duda mianował go na stopień generała brygady. 28 września 2023 w Trzebieniu jako dyrektor Zakładu Inwestycji Organizacji Traktatu Północnoatlantyckiego gen. bryg. Dariusz Mendrala uczestniczył w uroczystości otwarcia i przekazania do użytkowania miejsca stacjonowania wojsk na potrzeby sił sojuszniczych na terenie Ośrodka Szkolenia Poligonowego WL Żagań wraz z dowódcą Garnizonu Sił Zbrojnych USA w Polsce, dyslokowanego w Poznaniu, płk. Christianem Churchem, zastępcą dowódcy 10 BKPanc, szefem Rejonowego Zarządu Infrastruktury w Zielonej Górze płk. Dariuszem Bieleckim.
W latach 2021–2025 pełnił funkcję Dyrektora Zakładu Inwestycji Organizacji Traktatu Północnoatlantyckiego.