Działalność polityczna Po opuszczeniu przez Jomo Kenyattę więzienia i założeniu przez niego Afrykańskiego Narodowego Związku Kenii została członkinią partii. W późniejszych latach była zastępczynią sekretarza, a później sekretarzem oddziału partii w Kiambu. Po odzyskaniu przez Kenię niepodległości od Wielkiej Brytanii i wygranych przez partię , jej ojciec został premierem kraju. Margaret Kenyatta zaangażowała się w działalność promowania aktywności politycznej wśród kobiet w kraju. W tym samym roku została wybrana radną w Nairobi, reprezentując okręg wyborczy . Czterokrotnie uzyskiwała reelekcję na to stanowisko. Odmówiła startu do kenijskiego parlamentu w maju 1966 roku.
W 1969 roku została wybrana zastępczynią burmistrza Nairobi. Dwa lata później, w 1971 roku wybrano ją burmistrzynią miasta. Została pierwszą afrykańską kobietą na stanowisku burmistrzyni miasta w Kenii oraz drugą w historii kobietą na stanowisku burmistrza w kraju (wcześniej kolonialną burmistrzynią Nairobi była Gwladys Cholmondeley). Funkcję burmistrzyni pełniła przez dwie kadencje, do