Figura razem z dolną częścią kaplicy nie została uszkodzona i pełniła znowu rolę kościoła parafialnego. W 1925 r. dokończono odbudowę kościoła parafialnego, wówczas cudowna figura została do niego przeniesiona i umieszczona w starej drewnianej ambonie (nawa północna). W tym czasie uszkodzoną górną część kaplicy rozebrano, a jej dolną część zasypano ziemią. Na pamiątkę miejsca w 1965 została wmurowana tablica w ogrodzenie kościelne, wskazująca miejsce, gdzie znajdowała się kaplica „Więzienia Chrystusa”. Podczas remontu kościoła w 1959 usunięto starą ambonę, a statuę Jezusa przy słupie przeniesiono do prowizorycznego ołtarza. Z inicjatywy czciciela Jezusa w Więzieniu ks. Franciszka Gawlika, miejscowego proboszcza (pochodzącego z pobliskiej Moszczenicy, znającego kult Gorlickiego Jezusa) w 1961 r. figurę poddano renowacji i przygotowywano nowy ołtarz. Nowy ołtarz zaprojektował inż. Jan Budzidło, wykonany jest wyłącznie z kamienia i żelaza, podkreślając surowością więzienie Chrystusa (prace kamieniarskie wykonał Ludwik Kurdziel z Ptaszkowej, a metalowe Leon Przybyłowicz z Gorlic). Po powrocie cudownej figury Jezusa, 31 marca 1963 r. biskup tarnowski Jerzy Ablewicz (1925–1992 parafia należała do diecezji tarnowskiej) dokonał poświęcenia nowego ołtarza, gdzie została umieszczona na stałe figura.