Częstym wyzwaniem w sterowaniu USV jest uzyskanie płynnej reakcji przy przejściu od pełnego biegu wstecz do pełnego biegu naprzód. Jednostki załogowe zwykle charakteryzują się szeroką martwą strefą wokół położenia „stop”. Aby osiągnąć dokładne sterowanie różnicowe, system sterowania musi kompensować tę martwą strefę. Silniki spalinowe zwykle przekazują napęd przez przekładnię, co oznacza nieuniknioną nagłą zmianę przy jej załączaniu; system sterowania musi to uwzględniać. Napędy strugowodne stanowią tu wyjątek, ponieważ dostosowują ciąg płynnie przez punkt zerowy. Napędy elektryczne często mają podobną martwą strefę, dlatego system sterowania musi zachować tę charakterystykę z myślą o człowieku na pokładzie, a jednocześnie ją wygładzać na potrzeby sterowania automatycznego, np. podczas manewrów z małą prędkością i przy pozycjonowaniu dynamicznym.
Oceanografia, hydrografia i monitoring środowiskowy thumb|upright|USV używany w badaniach oceanograficznych (czerwiec 2011)