Operat ochrony zasobów wodnych Tatrzańskiego Parku Narodowego” Zakład Biologii Wód PAN, TPN..
Uczestniczył w międzynarodowych projektach, realizowanych również w Tatrach: AL:PE 2 – Acidification of remote mountain lakes: Paleolimnology and Ecology (lata 1993–1996), MOLAR – Mountain Lake Research (lata 1997–1999), EMERGE – European Mountain Lake Ecosystems: Regionalisation, Diagnostics & Socio-Economic Evaluation (lata 2000–2003).
Badał także ugrupowania Chironomidae w potokach Kaukazu, Starej Płaniny (Bułgaria), Hindukuszu (Afganistan), Alp oraz w Laponii (Finlandia).
Jednym z efektów jego działalności był opis dziesięciu nowych dla nauki taksonów Chironomidae z wód górskich: Kownacki & Kownacka, 1970; Kownacki & Kownacka, 1973; Kownacki & Kownacka, 1973; Kownacki & Kownacka, 1973; Kownacki & Kownacka, 1973; adzharicus Kownacki & Zosidze, 1973; Kownacki & Kownacka, 1975; Kownacki & Kownacka, 1980; Kownacki, 1982 i Kownacki, 1982.