Od czasów rzymskich do 1948 roku działał tam kamieniołom wapieni mioceńskich .
Przyroda Jezioro Nezyderskie jest silnie zasolone; jego średnia głębokość wynosi 50–60 cm, a maksymalna 180 cm. Najpłytsza jest południowa część węgierska, przechodząca w bagna. Jezioro otaczają mokradła, stanowiące cenne siedlisko dla wielu gatunków roślin i zwierząt. Węgierska część jeziora jest niemal całkowicie pokryta szuwarem trzcinowym, tworzonym m.in. przez pałkę wąskolistną i turzyce.
Nad Jeziorem Nezyderskim licznie gniazdują ptaki. Występują tam m.in. bąk, czapla biała (ponad 700 par lęgowych), krwawodziób, perkoz dwuczuby, podróżniczek, pokrzewki z rodzaju Sylvia, sieweczka rzeczna, szablodziób, szczudłak, trzciniak, warzęcha, wąsatka, a także różne gatunki kaczek i gęsi. Typowymi gatunkami ryb Jeziora Nezyderskiego są ciosa, piskorz, sandacz pospolity i szczupak pospolity. Trzcinowiska zamieszkuje muławka bałkańska. Wśród stawonogów występują m.in. , łątka ozdobna oraz zalotka większa.