W dokumentacji NIST podkreślono także jego wkład w badania związane z GPS, międzynarodowym czasem atomowym i uniwersalnym czasem koordynowanym (UTC).

Według biogramu towarzyszącego wywiadowi oral history IEEE jego praca magisterska z 1965 dała początek wariancji Allana, a później, we współpracy z zespołem NBS, współtworzył także zmodyfikowaną wariancję Allana i wariancję czasu. Źródło NIST dotyczące historii tych metod wskazuje, że klasyczna wariancja Allana, zmodyfikowana wariancja Allana i wariancja czasu zostały przyjęte jako standardy IEEE.

Biogram IEEE przypisuje Allanowi także opracowanie w 1968 algorytmu skali czasu AT-1 do optymalnego łączenia odczytów zegarów atomowych na potrzeby oficjalnego czasu Stanów Zjednoczonych oraz istotny wkład w techniki porównywania zegarów z użyciem GPS common-view. W 1995 został włączony do NIST Gallery of Distinguished Alumni.

Dorobek Allana obejmuje ponad sto publikacji technicznych i rozdziałów w książkach, ze szczególnym naciskiem na zagadnienia synchronizacji czasu, systemów satelitarnych i standardów częstotliwości.