W 1963 roku wprowadzono możliwość zwiedzania wystaw z przewodnikiem, lekcje muzealne oraz warsztaty artystyczne. W 1978 roku rozpoczęto wydawanie biuletynu „”. W połowie lat 80. XX wieku dokonano kolejnej reorganizacji oraz odnowienia wystaw. W 1987 roku powstało muzealne centrum komputerowe, wykorzystywane także przez inne instytucje muzealne i galerie. Od 1995 roku instytucja jest współwydawcą . Zatrudniano 27 osób w 1995 roku.

Muzeum znajduje się w Rudolfinum, wzniesionym w 1888 roku, w tym samym budynku mieści się również , znajduje się ono w centrum Lublany; wejście do muzeum znajduje się od strony ulicy Muzejskiej 1. Przed budynkiem znajduje się pomnik historyka Janeza Vajkarda Valvasora. Placówka zmaga się z brakiem miejsca, dlatego co najmniej od 2007 roku planowano budowę nowego gmachu, ale plany te nie zostały zrealizowane.

Oddział , zarządzane przez muzeum od 1962 roku, znajduje się w Trencie; jest to najstarszy słoweński ogród botaniczny, założony w 1926 roku przez Alberta Bois de Chesne.

Dyrektorem muzeum jest geolog .