Konfiskowano dobra klasztorne, nakładano kontrybucje wojenne, a także przeprowadzono przegląd sił ludności podległej opactwu. W tym samym czasie Clavei prowadził działania kontrreformacyjne w Chełmsku Śląskim, wzywając mieszkańców do powrotu do praktyk katolickich i porządkując struktury parafialneS. Jaskólska, „Zabójstwo opata Martinusa Clavei”, Karkonosze. Czasopismo Sudetów Zachodnich, nr 2/2022, s. 26.. 28 lub 29 grudnia 1620 roku został zamordowany w Chełmsku Śląskim przez grupę mieszkańców. Został pochowany w kościele klasztornym w Krzeszowie. Po jego śmierci w styczniu 1621 roku opatem Krzeszowa został Jerzy II Henning, dotychczasowy administrator klasztoru.
Zabójstwo Tło wydarzeń Do zabójstwa opata Marcina Clavei doszło 28 lub 29 grudnia 1620 roku w Chełmsku ŚląskimK. Michalik, Krzeszów - Dom Łaski Maryi, Krzeszów 2018, s. 16. podczas jego wizyty w mieście w dniu targowym. Wydarzenie wiązało się z narastającymi napięciami między ludnością Chełmska Śląskiego oraz okolicznych miejscowości (m.in. Olszyn) a klasztorem, dotyczącymi kwestii ekonomicznych oraz zakresu jurysdykcji opactwa. Przebieg Podczas pobytu w mieście opat został zaatakowany przez grupę mieszkańców Chełmska Śląskiego oraz okolicznych miejscowości. Po rozpoczęciu ataku schronił się w domu burmistrza, który następnie został otoczony przez napastników.