metrologię czasu i częstotliwości, interferometrię atomową, symulacje układów materii skondensowanej oraz badania układów silnie skorelowanych.
Wśród wcześniejszych prac z jej udziałem znajdowała się propozycja toroidalnej pułapki dla atomów ultrazimnych, opartej na połączeniu pułapki magnetycznej dla atomów rf-dressed i stojącej fali świetlnej; autorzy wskazywali przydatność takiej geometrii do badań nad nadciekłością i układami o obniżonej wymiarowości. Była także współautorką eksperymentalnej pracy z 2012 roku, w której opisano wytwarzanie kondensatu Bosego-Einsteina rubidu-87 w optycznie zaślepionej pułapce kwadrupolowej oraz przedstawiono teoretyczną i doświadczalną analizę potencjału pułapkującego w niskich temperaturach.
Perrin współtworzyła również pracę o indukcyjnie sprzężonych pułapkach pierścieniowych dla atomów ultrazimnych, proponowanych jako układy użyteczne m.in. dla interferometrii atomowej i badań nadciekłości. W 2018 była współautorką pracy proponującej metodę przygotowywania stanów o zadanej skwantowanej cyrkulacji w pierścieniowych kondensatach Bosego-Einsteina za pomocą imprintingu fazy. Omówienie w APS Physics opisało eksperyment Perrin i współpracowników, w którym uzyskano długo żyjący rotujący pierścień nadciekły w kondensacie Bosego-Einsteina jako etap prowadzący do wytworzenia tzw. giant vortex.