Organizacja Organizacja pielgrzymki rowerowej zależy od długości trasy, liczby uczestników, charakteru grupy oraz celu religijnego. W przypadku pielgrzymek wielodniowych ustala się dzienne odcinki, miejsca noclegów, punkty postoju, zasady uczestnictwa, opiekę duszpasterską, zaplecze techniczne i sposób przewozu bagażu. Regulaminy pielgrzymek mogą wymagać od uczestników sprawnego roweru, kasku, przygotowania kondycyjnego i podporządkowania się zasadom jazdy w grupie.

W pielgrzymkach rowerowych istotne znaczenie ma bezpieczeństwo przejazdu, ponieważ uczestnicy poruszają się najczęściej po drogach publicznych, drogach lokalnych, drogach rowerowych lub szlakach turystycznych. Wymaga to planowania trasy z uwzględnieniem , dostępności noclegów, możliwości serwisowych, warunków pogodowych oraz doświadczenia uczestników.