Oprogramowanie Struktura Mirabilium Collectio została oparta na stworzonym przez PCSS w 1998 roku i rozwijanym oprogramowaniu dLibra (Digital Library Framework). W roku 2026, w momencie udostepnienia Mirabilium Collectio, była to dLibra7 (siódmej generacji). dLibra jest pierwszym polskim środowiskiem, służącym budowie bibliotek cyfrowych. System ten pierwotnie stanowił bazę dla polskich bibliotek cyfrowych (regionalnych i instytucjonalnych), które były uruchamiane w sieci PIONIER. Umieszczenie Mirabilium Collectio w cyfrowej strukturze Wielkopolskiej Biblioteki Cyfrowej oraz wykorzystanie protokołu OAI-PMH umożliwiło agregowanie danych i ich przesył również do ogólnoeuropejskiej platformy cyfrowej Europeana, za pośrednictwem Federacji Bibliotek Cyfrowych, polskiego agregatora metadanych.
Pliki zostały udostępnione w formatach PDF, JPEG, a także za pośrednictwem API za pomocą manifestu IIIF. Metadane zostały udostępnione do przeglądania online oraz do pobierania w formacie RDF i za pośrednictwem protokołu OAI-PMH.