31 grudnia 1867 poślubiła swojego kuzyna, dwudziestodwuletniego Algernona Godfreya Kingsforda. Był synem pastora i sam przygotowywał się do przyjęcia święceń. Jego ojciec posługiwał w więzieniu Millbank, gdzie Algernon przyszedł na świat. W 1852 ojciec popełnił samobójstwo, podrzynając sobie gardło. Bez majątku i pozycji Algernon nie był uważany przez matkę Anny za dobrą partię – tym bardziej że ciążyło na nim piętno samobójstwa ojca. Początkowo odmówiono mu ręki Anny, a ją samą wysłano do Szwajcarii. Uciekła jednak z Algernonem. Przyszły mąż obiecał pozostawić jej pełną swobodę oraz prawo do wykonywania zawodu, który sobie wybierze, co w jej oczach czyniło go odpowiednim kandydatem na męża. Para postanowiła pobrać się, gdy tylko Anna osiągnie pełnoletniość.
Po krótkiej podróży poślubnej młodzi małżonkowie przenieśli się do Lichfield, gdzie Algernon się kształcił. 24 września 1868 w St Leonards-on-Sea Anna urodziła jedyne dziecko, córkę Eadith. Wkrótce potem małżonkowie mieli postanowić, że będą „żyć jak brat i siostra” – Kingsford uważała bowiem wstrzemięźliwość seksualną za jeden z atrybutów prawdziwego adepta duchowego. Ciąża przebiegła źle, a wątłe zdrowie Anny pogorszyło się.