Samuel stał się także jednym z pierwszych dokumentalistów w swoim nowym kraju, fotografując i filmując ważne wydarzenia oraz miejsca w całej Portugalii.
14 lutego 1915 w Lizbonie Agata urodziła jedyne dziecko pary, córkę Clarę Schwarz.
Badania nad diasporą żydowską Szwarc zainteresował się kryptojudaizmem iberyjskim i marranami podczas swojego pobytu w Hiszpanii, gdzie poznał krypto-żydowskich Xuetes z Majorki. W latach 1907–1910 opublikował kilka artykułów o marranach w czasopiśmie Galicyjskiej Akademii Królewskiej, której został członkiem, oraz w czasopiśmie España-Nueva. W latach 1908–1909 opublikował podobne artykuły w języku francuskim.
W 1917 roku praca zawodowa Szwarca jako inżyniera górnictwa i jego zainteresowanie kryptojudaizmem zaprowadziły go do Belmonte w regionie Trás-os-Montes w Portugalii. W tamtym czasie Pierwsza Republika Portugalska cieszyła się względną swobodą intelektualną, zwłaszcza w porównaniu z późniejszym autorytarnym i korporacjonistycznym reżimem Estado Novo. W Belmonte odkrył stele z czytelnymi hebrajskimi inskrypcjami, które, jak wywnioskował, należały do starej synagogi. Podczas pobytu w Belmonte Szwarc spotkał również Baltasara Pereirę de Sousę. Jego ciekawość wzbudziła ponoć otrzymana informacja, by nie robił interesów z Sousą, gdyż jest on Żydem.