(pol. Kim byli emisariusze, których król Jan II wysłał w poszukiwaniu Księdza Jana?). Pozostał także zaangażowany w inżynierię górniczą, pisząc w 1936 broszurę dla Portugalskiej Dyrekcji Kopalń zatytułowaną Arqueologia mineira: extrato dum relatório acerca de pesquisas de ouro (pol. Archeologia górnicza: fragment raportu dotyczącego poszukiwań złota).
Później w życiu Schwarza pojawiły się problemy zdrowotne, które ostatecznie uniemożliwiły mu odwiedzanie żyjących braci, siostrzenic, bratanków i innych krewnych, którzy osiedlili się w Izraelu i gdzie indziej.
Śmierć i dziedzictwo Samuel Schwarz zmarł w Lizbonie 10 czerwca 1953, krótko po śmierci swojej żony Agaty.
Po śmierci jego biblioteka, składająca się głównie z judaików – w tym 32 inkunabułów i 10 tys. innych rzadkich książek – została sprzedana rządowi Portugalii. Księgozbiór, choć miał pozostać w Tomar, trafił do Archiwum Historycznego Ministerstwa Finansów Portugalii, gdzie przez dziesięciolecia był przechowywany. Obecnie kolekcja znajduje się w Bibliotece Nauk Społecznych im. Mário Sottomayora Cardii na Universidade Nova de Lisboa, gdzie podjęto się jej inwentaryzacji i katalogowaniu jako Biblioteca Samuel Schwarz.