Spełniając życzenie papieża Piusa XI, aby świeccy współpracowali z duchowieństwem w szerzeniu przesłania Chrystusa światu, Caruana w 1930 kanonicznie ustanowił Akcję Katolicką pod nazwą Federazione della Gioventù Cattolica Maltese. Co więcej, pomimo nakazu przeprowadzenia w 1916 dochodzenia w sprawie praktyk Societas Doctrinae Christianae (założonego przez o. Ġorġa Precę w 1907, wkrótce po jego święceniach kapłańskich), z deklaracją, że nigdy go nie zatwierdzi, 12 kwietnia 1932 kanonicznie zatwierdził M.U.S.E.U.M. dla diecezji Malty i Gozo.
Podczas II wojny światowej arcybiskup Caruana wzywał Maltańczyków do podjęcia pełnego wysiłku w celu zwycięstwa nad państwami Osi. W przemówieniu do Maltańczyków z 26 grudnia 1942 powiedział:
Podziękował też marynarzom z marynarki handlowej, Royal Navy oraz RAF-u za ich odwagę i oddanie.
Przeprowadził wyspę przez bombardowania przez nazistowską Luftwaffe i włoskie siły powietrzne. Podczas 20-godzinnej wizyty króla Jerzego VI na Malcie 20 czerwca 1943 został przez niego przyjęty na specjalnej audiencji. Tego samego dnia Caruana zasłabł i poważnie zachorował.
Śmierć Mauro Caruana zmarł 17 grudnia 1943 po długiej chorobie. Został pochowany w kościele parafialnym św.