W przypadku awansu, którejś z drużyn nierozstawionej, w III rundzie przejmuje ona współczynnik najwyżej rozstawionego rywala.

Oznaczenia Drużyny, które awansowały z II rundy eliminacyjnej zachowując swój współczynnik. Drużyny, które zaczęły rywalizację od III rundy eliminacyjnej. Drużyny, które awansowały z II rundy eliminacyjnej, przejmując współczynnik rywala.

Ścieżka mistrzowska

Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. FK Crvena zvezda46.500 Dinamo Zagrzeb46.500 Slovan Bratysława36.000 Aarhus GF27.250 NK Celje23.000 Kajrat Ałmaty21.250 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Ararat-Armenia19.375 Sabah Baku14.000 Hapoel Beer Szewa14.000 Mjällby AIF13.500 Lewski Sofia10.500 Žalgiris Kowno10.500

Ścieżka ligowa Drużyny rozstawioneDrużynaWsp. Olympique Lyon65.750 FK Bodø/Glimt64.000 Olympiakos SFP62.250 Fenerbahçe SK57.750Drużyny nierozstawioneDrużynaWsp. Union SG48.000 Sparta Praga38.250 Sturm Graz28.000 NEC13.585

Pary III rundy kwalifikacyjnej

Pierwsze mecze

Ścieżka mistrzowska

Ścieżka ligowa

Rewanże

Ścieżka mistrzowska

Ścieżka ligowa

Runda play-off W tej rundzie kwalifikacji utrzymany został podział na 2 ścieżki – mistrzowską i ligową: