Rozgrywka Colorado jest grą przygodowo-zręcznościową, w której gracz steruje głównym bohaterem za pomocą klawiatury lub joysticka, eksplorując trójwymiarowy świat gry. Gra została podzielona na kilka etapów połączonych spływami canoe rzeką Kolorado. Każdy etap zawiera główne zadanie, którego wykonanie umożliwia dalsze postępy w grze. W czasie spływów gracz omija skały, powalone drzewa oraz wrogie canoe, starając się dopłynąć do wyznaczonego miejsca lądowania; jego minięcie powoduje porwanie łodzi przez wodospad. Rzeka łączy cztery główne obszary, pozwala na podróż wyłącznie w dół rzeki i może na stałe przenieść gracza poza pewne obszary.
Gra łączy dwie różne perspektywy: pochylony widok z boku, idealny do eksploracji, oraz widok zza ramienia, pseudo-3D, podczas podróży rzeką. Pochylona perspektywa pozwala na ograniczone poruszanie się w głąb ekranu i bardziej złożone ścieżki rozgałęzień niż w typowych grach akcji z przewijaniem bocznym. Postać może poruszać się nie tylko w poziomie, ale również w głąb ekranu i w jego kierunku, co daje ograniczoną możliwość przemieszczania się w trzecim wymiarze. Oprócz chodzenia bohater potrafi skakać, wspinać się, kucać, chować się za elementami otoczenia, przeładowywać karabin, przełączać się pomiędzy postawą pokojową i bojową oraz używać i badać znalezione przedmioty.