Klub zajął piąte miejsce i zakwalifikował się do baraży o awans, ale przegrał bezpośrednio z FC Sochaux-Montbéliard (1:2).
Po odejściu Ousmane'a Camary do Angers SCO, w sezonie 2022/23 ugruntował swoją pozycję w środku obrony. Rozegrał pełny sezon na tej pozycji, biorąc udział w 35 meczach Ligue 2, z czego 31 razy w pierwszym składzie. Jego drużynie tym razem nie udało się walczyć o czołowe miejsca w tabeli i zajęła siódme miejsce.
Dinamo Zagrzeb Bernauer przeniósł się do Chorwacji i podpisał kontrakt z Dinamo Zagrzeb latem 2023 roku. Transfer ogłoszono w czerwcu 2023 roku, a zawodnik podpisał kontrakt obowiązujący do czerwca 2027 roku.
Swój pierwszy mecz w barwach Dinamo rozegrał 29 lipca 2023 roku w spotkaniu ligowym przeciwko NK Istra 1961. Wystąpił w pierwszym składzie, a jego drużyna wygrała 3:0. Bernauer strzelił swoją pierwszą bramkę dla Dinamo 8 października 2023 r. w meczu ligowym, również przeciwko NK Istra 1961. Wystąpił w pierwszym składzie i przyczynił się do zwycięstwa swojej drużyny (3:0).
W Chorwacji po raz pierwszy zetknął się z rozgrywkami europejskimi, ponieważ Dinamo startowało w Lidze Konferencji Europy. Pod koniec sezonu zdobył tytuł mistrza Chorwacji. Tytuł ten zapewnił chorwackiemu klubowi awans do Ligi Mistrzów.