Trzy rysunki przedstawione przez Michała Anioła nie zachowały się do naszych czasów (z wyjątkiem kilku szkiców detali) i nie ma pewności, czy dzieło zostało faktycznie zrealizowane ściśle z pierwotnym projektem. Niemałą rolę w zdefiniowaniu ostatecznego wyglądu dzieła odegrali asystenci Buonarrotiego, który miał wówczas osiemdziesiąt pięć lat i prawdopodobnie nie był w stanie śledzić prac z właściwą mu drobiazgowością. Jest zatem bardzo prawdopodobne, że oryginalny projekt uległ zmianom. Można to wywnioskować z pamiątkowego medalu z brązu, wybitego w 1561 roku przez Giana Federica Bonzagnę z okazji rozpoczęcia prac, oraz z ryciny Bartolomea Faletiego z 1568 roku, na których Porta Pia ma wygląd dość znacznie różniący się od obecnego. Kwestii tej nie da się jednak jednoznacznie wyjaśnić, ponieważ już około czterdzieści lat po wzniesieniu bramy, ówczesne mapy topograficzne Rzymu przedstawiają ją niemal jako ruinę: być może w wyniku uderzenia pioruna jej attyka uległa poważnemu uszkodzeniu i w takim stanie brama pozostawała aż do renowacji w XIX wieku. Historycy sztuki spekulują również, że na wczesną destrukcję attyki mogły wpłynąć także niedociągnięcia konstrukcyjne wynikające z braku stałego nadzoru autora nad budową.