Zagrożenia i ochrona IUCN uznaje bystrolota ciemnego za gatunek najmniejszej troski. Gatunek rozpoznano po raz pierwszy w 1996, klasyfikując go jako najniższego ryzyka / bliski zagrożenia. W 2008 uznano go już za gatunek najmniejszej troski, co powtórzono w ocenie z 2019 opublikowanej w 2020. IUCN uzasadnia ocenę szerokim zasięgiem występowania, jego obfitością i trendem populacyjnym, który nie wydaje się obniżać.
Całkowita liczebność populacji tego gatunku nie została oszacowana, zwierzę jednak zdaje się występować pospolicie i na dużym obszarze. Bywa nawet gatunkiem dominującym. Nie występuje znaczna fragmentacja.
Trend populacyjny nie jest wiadomy.
Bystrolot ciemny pada ofiarą polowań dla mięsa. Jednak polowania te nie są tak nasilone, by mogły zagrozić istnieniu gatunku.
Zwierzę zamieszkuje liczne tereny objęte ochroną.
Przypisy 23. Common Swift Fruit Bat, s. 74–75, w:
15. Brooks's Dayak Bat, s. 71, w: 16. Common Dayak Fruit Bat, s. 71, w: 17. Philippine Large-headed Fruit Bat, s. 72, w: 18. Blanford's Fruit Bat, s. 72, w: 19.