Po wygranej Trumpa w wyborach zajął funkcję doradcy ds. politycznych. Był odpowiedzialny za kształtowanie polityki imigracyjnej. Był zwolennikiem polityki rozdzielania imigranckich rodzin – odbierania dzieci rodzicom, którzy nielegalnie przekroczyli amerykańsko-meksykańską granicę. Razem z Bannonem współtworzył wiele rozporządzeń wykonawczych podpisanych przez prezydenta. Pozostał w gronie sojuszników Trumpa także po ataku na Kapitol 6 stycznia 2021 roku. Po przegranych przez Trumpa wyborach w 2020 r., Miller opuścił Biały Dom i założył organizację non-profit America First Legal Foundation.
Praca w drugiej administracji Trumpa Po wygranej prezydenta w wyborach w 2024 r. został zastępcą szefa personelu Białego Domu, a także doradcą prezydenta ds. bezpieczeństwa wewnętrznego. Jest uważany za jedną z najbardziej wpływowych osób w otoczeniu prezydenta. Tak jak podczas pierwszej kadencji, Miller jest skoncentrowany na kreowaniu polityki imigracyjnej. Jest określany jako architekt polityki masowych deportacji przeprowadzanych przez służby za prezydentury Trumpa.