W środkowym biegu rzeka przepływa przez gminę Großarl, przyjmując liczne potoki spływające z bocznych dolin. Poniżej miejscowości dolina stopniowo się zwęża, a Großarler Ache wcina się pomiędzy skalne zbocza oddzielające Großarltal od doliny Salzach.
W dolnym biegu rzeka skręca ku zachodowi i przepływa przez Liechtensteinklamm. Wąwóz ma około 4 km długości, a jego ściany osiągają do około 300 m wysokości. Po opuszczeniu przełomu Großarler Ache przepływa przez krótki odcinek doliny i uchodzi do Salzach na wysokości około 572 m n.p.m..
Zlewnia i dopływy Zlewnia Großarler Ache obejmuje powierzchnię 237,9 km². Od wschodu ograniczają ją grzbiety grupy Ankogel, natomiast od zachodu Radstädter Tauern. Za pośrednictwem Salzach, Innu i Dunaju należy do zlewiska Morza Czarnego.
Do większych dopływów należą: prawostronne: Schöderbach, Kreealmbach, Maurachbach, Karteisbach, Doppelbach, Ellmaubach, Lambach i Eggbach; lewostronne: Hubalmbach, Reitalmbach, Toferer Bach, Bacher Graben, Aigenbach, Unterbergbach i Schiedbach.
Największym dopływem jest prawostronny Ellmaubach, którego zlewnia zajmuje około 29,5 km². Uchodzi on do Großarler Ache w miejscowości Großarl, odprowadzając wody z doliny Ellmautal.