W zachodniej części świątyni znajduje się chór muzyczny.
Najcenniejszym elementem wyposażenia jest barokowy ołtarz główny z 2. ćwierci XVIII wieku, o dekoracji regencyjnej, przeniesiony z kościoła pijarów w Warszawie. W jego centrum znajduje się krucyfiks, a ołtarz uzupełniają rzeźby Matki Boskiej, św. Jana i św. Marii Magdaleny. W świątyni znajdują się także neobarokowe ołtarze boczne. W prawym umieszczono XVIII-wieczny obraz Matki Boskiej Częstochowskiej w srebrnej sukience, otaczany szczególnym kultem. W lewym ołtarzu znajduje się obraz św. Zygmunta, patrona kościoła, przesłaniany wizerunkiem Matki Bożej Nieustającej Pomocy. W kolejnym ołtarzu bocznym znajduje się obraz św. Rocha z 1889 roku autorstwa Wojciecha Gersona.
Wśród pozostałych zabytków znajdują się barokowe obrazy św. Stanisława i św. Wojciecha z 2. połowy XVII wieku, prawdopodobnie pochodzące z dawnego kościoła w Cieciszewie, a także obrazy Śmierci św. Franciszka Ksawerego i św. Jana Nepomucena. W wyposażeniu zachowały się również barokowa marmurowa chrzcielnica z 1. połowy XVIII wieku, barokowa monstrancja z 4. ćwierci XVII wieku oraz barokowe relikwiarze w kształcie krzyża.