Oceniał także skuteczność organicznych i nieorganicznych związków mineralnych w profilaktyce i leczeniu chorób niedoborowych.
W ramach prac badawczych realizowanych w Pracowni Biotechniki Rozrodu Zwierząt zajmował się przyczynami niepłodności, niskiej skuteczności zabiegów embriotransferu u jałowic oraz analizą wad cytogenetycznych i mutacji recesywnych w genomie bydła. We współpracy z Zakładem Fizjopatologii Rozrodu i Gruczołu Mlekowego uczestniczył w badaniach dotyczących nieswoistych metod profilaktyki oraz terapii skojarzonej (z użyciem antybiotykoterapii) w przebiegu zapalenia wymienia (mastitis) i zapalenia macicy (metritis) u krów. Dorobek naukowy dr. hab. Marka Gehrke obejmuje ponad 100 publikacji, z których większość stanowią oryginalne prace twórcze.
Nagrody i wyróżnienia W 2023 roku został wyróżniony II miejscem w konkursie Zarządu Głównego Polskiego Towarzystwa Nauk Weterynaryjnych na oryginalną pracę badawczą ogłoszoną w czasopiśmie z listy JCR. Nagrodę przyznano zespołowi w składzie: Bartosz Jaśkowski, Monika Herudzińska, Marek Gehrke oraz Wojciech Niżański za publikację pt. The impact of the cavitary corpus luteum on the blood progesterone concentration and pregnancy rate of embryo recipient heifers, opublikowaną w czasopiśmie Theriogenology w 2022 roku.