W latach 1990–1991 Volksbund przystosował teren do przyjęcia ponad 2500 niemieckich poległych i zmarłych podczas II wojny światowej. Ich szczątki znajdowały się po wojnie na Cmentarzu Wojskowym na Powązkach w Warszawie. Prowadzone tam prace budowlane spowodowały konieczność przeniesienia pochówków. Nekropolię w Joachimowie-Mogiłach udostępniono publiczności 5 października 1991 roku.
22 czerwca 1995 cmentarz w granicach ogrodzenia wpisano do rejestru zabytków pod numerem 994 A. Obiekt jest także ujęty w ewidencji zabytków Narodowego Instytutu Dziedzictwa.
W pracach porządkowych i konserwacyjnych na cmentarzu uczestniczyli między innymi żołnierze i rezerwiści 73 Skrzydła Lotnictwa Taktycznego z Laage w Niemczech.
Układ i forma upamiętnienia Cmentarz ma układ pierścieniowy i jest otoczony niskim ogrodzeniem, w które w regularnych odstępach wkomponowano krzyże z czerwonego piaskowca. Jego centralnym elementem jest okrągły monument, również wykonany z czerwonego piaskowca, którego forma nawiązuje do twierdzy. Przed monumentem umieszczono dwujęzyczną tablicę pamiątkową, a na jego górną część prowadzą dwa biegi schodów.