Był powiernikiem Uniwersytetu Pensylwanii i pełnił funkcję przewodniczącego muzeum Uniwersytetu Pensylwanii. Wykorzystał swój prywatny jacht Caroline II do ekspedycji archeologicznej na Wyspę Wielkanocną. Poprowadził kolejną ekspedycję do Piedras Negras w Gwatemali, aby odnaleźć brakujące głowy figur znalezionych wcześniej. Przywiózł stamtąd tron, który został przekazany muzeum Uniwersytetu Pensylwanii. Kupił oryginalny rękopis Alicja w Krainie Czarów od za 150 000 dolarów.
Dziedzictwo Johnson podarował Cooper Library i otaczający ją teren miastu Camden w New Jersey z przeznaczeniem na Eldridge R. Johnson Park.
W 1927 roku przekazał 800 000 dolarów Uniwersytetowi Pensylwanii na utworzenie Eldridge R. Johnson Foundation do badań nad fizyką medyczną.
26 lutego 1985 roku Johnson pośmiertnie otrzymał Grammy Award Trustees Award za znaczący wkład w dziedzinę nagrań dźwiękowych.
Johnson Victrola Museum zostało założone w Dover w Delaware na cześć Johnsona i zawiera fonografy, pamiątki, fotografie oraz jego nagrodę Grammy.