Członkowie grupy Alsos przesłuchali , Niemca, który prowadził badania jądrowe zarówno dla Niemiec, jak i dla ZSRR, na temat zakresu radzieckiego projektu.
Związek Radziecki nie został oficjalnie poinformowany o projekcie Manhattan aż do momentu, gdy Stalin został poinformowany o nim przez prezydenta USA Harry'ego S. Trumana podczas konferencji poczdamskiej 24 lipca 1945 roku. Kiedy prezydent Truman poinformował Stalina o nowej broni, zaskoczył go spokój, z jakim Stalin przyjął tę informację, i uznał, że Stalin nie zrozumiał tego, co mu powiedziano. Inni członkowie delegacji amerykańskiej i brytyjskiej, którzy uważnie obserwowali tę wymianę zdań, doszli do tego samego wniosku.
W rzeczywistości Stalin od dawna wiedział o programie, mimo że projekt Manhattan był objęty tak wysoką klauzulą tajności, iż nawet jako wiceprezydent Truman nie wiedział o nim ani o pracach nad bronią (Truman został o nim poinformowany dopiero wkrótce po objęciu urzędu prezydenta). Aresztowanie Klausa Fuchsa w 1950 roku doprowadziło do zatrzymania wielu innych podejrzanych o szpiegostwo na rzecz Związku Radzieckiego, w tym Harry’ego Golda, Davida Greenglassa oraz Ethel i Juliusa Rosenbergów (oboje zostali osądzeni i straceni za szpiegostwo).