Pod koniec serialu, pokazane jest, że Dummy Plugi używane do autopilotowania Evangelionów są właściwie zrobione z klonów Rei Ayanami albo Kaworu Nagisy.
Prototypowe/Testowe jednostki EVA Evangeliony pre-jednostki 00 Zostało zrobionych kilka prototypowych jednostek EVA, które okazały się niepowodzeniem. Można to zobaczyć na cmentarzu Evangelionów. Wszystkie miały pomarańczowy pancerz. Większość biologicznych części tych Evangelionów zgniło, a pozostała tylko głowa (maska) połączona z kręgosłupem i często niepełna liczba kończyn. Mają napisane na głowach dużymi czerwonymi literami „reject” (ang. odrzucono).
Evangelion jednostka 00 (zerogōki) Jednostka 00 to prototyp, pierwsza udana próba stworzenia Jednostki Eva. Jest ona pilotowana przez pierwsze dziecko, Rei Ayanami. Projekt głowy jest podobny do głów pre-jednostek. Jednostka ta była najpierw pomalowana na pomarańczowo, ale po uszkodzeniach jakich doznała w walce z piątym Aniołem Ramielem, pancerz został wymieniony na niebieski, dokonano także innych modyfikacji aby lepiej przystosować jednostkę do walki (w mandze jednostka zachowuje pomarańczowy pancerz). Zostały dodane także wystające części na barkach Evy;